El apellido Baquerín (con sus variantes documentales Vaquerín, Baquerin o Vaquerin) es un linaje hispánico de naturaleza ocupacional o patronímica diminutiva. Se encuadra dentro de los apellidos de raíz ganadera tradicional del norte castellano, con una notable implantación solariega e histórica radicada en la Merindad de Castilla la Vieja.

Su origen geográfico e histórico se vincula al norte de la Corona de Castilla durante la época feudal y la época de la Monarquía, con primitivo y señalado arraigo en la ciudad de Medina de Pomar (Burgos), cabeza y corazón de las Merindades burgalesas. Nació a partir de la derivación diminutiva, afectiva o filial del tronco ocupacional Vaquero o Baquero, designando originariamente al hijo del vaquero («el joven vaquerín») o bien al zagal y pastor especializado en la guarda y custodia del ganado vacuno joven en pastos y dehesas de la comarca.

Etimológicamente procede del sustantivo romance vaquero / baquero (derivado del latín vaccarius, de vacca, «vaca»), al que se incorpora el sufijo diminutivo de origen latino -inus (-ín):

En la morfología romance castellana, el sufijo -ín posee valor hipocorístico, filial o de menor escala física («el pequeño vaquero» o «hijo de Vaquero»).

En su vertiente funcional, aludía al mozo pecuario encargado de las labores auxiliares de la vaquería y del cuidado de terneros.

A nivel ortográfico, en los protocolos notariales y eclesiásticos de las Merindades se aprecia la alternancia constante entre las grafías con B y con V (Baquerín / Vaquerín), fenómeno propio del betacismo peninsular.

Históricamente, el apellido se concentró en la comarca de Las Merindades de Burgos (con eje en Medina de Pomar) y se proyectó hacia otras zonas de Castilla y León (partidos judiciales de Palencia, Burgos y Valladolid) y áreas limítrofes cántabras:

Frecuencia contemporánea: Es un linaje de frecuencia estadística sumamente baja (clasificado como linaje raro o infrecuente).

Los portadores actuales se localizan de manera dispersa en la provincia de Burgos, la comunidad de Castilla y León, y con presencia secundaria en Madrid y el País Vasco como resultado de los movimientos migratorios del siglo XX.

La trayectoria histórica de la casa de Baquerín de Medina de Pomar se inserta en el desarrollo social, mercantil y administrativo de esta estratégica villa de Las Merindades:

Durante la época de la Monarquía, los miembros de este solar participaron en la vida pública de la ciudad, vinculándose a la administración local, al régimen señorial de los Condestables de Castilla (duques de Frías) y a la propiedad de heredades y censos en el entorno del río Nela.

Con la generalización de los registros sacramentales a partir del siglo XVI, el linaje quedó asentado de forma regular en las parroquias medinesas, figurando como vecinos arraigados y propietarios en el tejido urbano y rural circundante.

El linaje y su casa de Medina de Pomar cuentan con testimonios en diversos repositorios documentales:

Archivos parroquiales y eclesiásticos: Libros de bautismos, matrimonios y defunciones de las históricas parroquias de Medina de Pomar (Santa Cruz y Nuestra Señora del Rosario) y del entorno diocesano de Burgos.

Archivos concejiles y municipales: Padrones de vecinos, actas de acuerdos concejiles y memoriales de propios conservados en el Archivo Municipal de Medina de Pomar y en los fondos de la Merindad de Castilla la Vieja.

Protocolos notariales: Escrituras de mayorazgos, censales, particiones de bienes y cartas de dote custodiadas en el Archivo Histórico Provincial de Burgos (distrito notarial de Villarcayo / Medina de Pomar).

Archivos judiciales de la Corona: Pleitos de hidalguía, probanzas de vecindad y ejecutorias litigadas ante la Sala de los Hijosdalgo de la Real Chancillería de Valladolid.

Dentro del ámbito local, comarcal y de la administración de la época, destacaron:

Jurados, regidores y procuradores del concejo de Medina de Pomar durante los siglos XVII y XVIII.

Oficiales y procuradores vinculados a la administración y curia señorial del ducado de Frías en Las Merindades.

Escribanos públicos y receptores con ejercicio notarial en la Merindad de Castilla la Vieja documentados en protocolos de los siglos XVII y XVIII.

Al surgir a partir de una voz de raíz ocupacional o patronímica, el apellido en su conjunto global no supuso una condición de nobleza generalizada. No obstante, la casa solariega de Medina de Pomar y sus ramas derivadas que alcanzaron hidalguía notoria litigarion y probaron su condición de hijosdalgo de sangre ante la Real Chancillería de Valladolid:

Obtuvieron sus correspondientes ejecutorias de hidalguía, garantizando su exención del pago de pechos y tributos ordinarios y su legítimo derecho a ser inscritos en los padrones de nobles y al desempeño de oficios concejiles reservados al estado hidalgo.

Casa solar principal: Radicada en la ciudad de Medina de Pomar (Burgos), solar primitivo documentado desde donde el linaje mantuvo posesión territorial y vecindad cualificada.

Ramas derivadas: A partir del siglo XVII se documentan líneas filiales dimanadas de este solar medinés en otras localidades de Las Merindades (como Villarcayo y Espinosa de los Monteros), así como ramas que pasaron a la Bureba y a comarcas de la cuenca del Duero (Tierra de Campos y Palencia).

Desde su núcleo originario en las Merindades burgalesas:

Se produjo una difusión paulatina hacia las cabeceras judiciales de Burgos y villas comarcales en las centurias modernas.

Durante los siglos XIX y XX, al compás del desarrollo industrial, ramas del linaje se trasladaron hacia las provincias vascas limítrofes (Vizcaya y Álava), así como a Madrid y Valladolid capital.

Se registran testimonios esporádicos en América derivados de la emigración de finales del siglo XIX.

En campo de oro, una peña de su color natural, entre ondas de agua de azur y plata, y sobre la peña, una torre de piedra parda con homenaje, circundada de cinco estrellas de gules.

Otros: En campo de plata, una panela de sinople, atravesada de un dardo de sable.