El apellido Ilisi (registrado en las fuentes históricas vasconavarras e hispánicas bajo las variantes Ilisi, Ylisi, Ilis, Ylis, Iliso e Ilisategui, estandarizado en la normativa euskérica académica contemporánea como Ilisi / Ilarzo) es un linaje noble de origen toponímico, oikónimo, euskérico y de casa solariega, procedente del Territorio Histórico de Guipúzcoa —con cuna y solares matrices históricos radicados en las comarcas del Urola Medio (Azpeitia, Azkoitia) y Tolosaldea (Andoain, Tolosa)— y del colindante Reino de Navarra (valles de Baztan y Ultzama).

Surgió en la Baja Edad Media para filiar y designar a los caballeros e hijosdalgo posesores de la casona señorial, torre o caserío exento radicado en el paraje del brezal ("los del solar de Ilisi" / "Casa Ilisi"), adoptándose como oikónimo del solar y fijándose como apellido hereditario de linaje.

En los padrones de hidalguía, expedientes de probanza de las Chancillerías Reales y libros sacramentales de los siglos XV al XIX consta anotado bajo las grafías históricas Ilisi e Ylisi, adaptando la terminación euskérica vocalicil (-i) según la costumbre de la escribanía romance.

Tuvo sus primitivas casonas matrices e hidalgas en Guipúzcoa (Azpeitia, Azkoitia, Andoain, Tolosa) y en el Reino de Navarra (Baztan, Ultzama), extendiéndose tempranamente por el Señorío de Vizcaya, Álava, la Corona de Castilla y el ámbito hispanoamericano a partir del siglo XVIII (con presencia en México, Argentina, Chile, Colombia, Perú y Uruguay).

Registrado en los padrones de nobleza e hidalguía de las Juntas Generales de Guipúzcoa, en los procesos del Consejo Real de Navarra, en las informaciones de probanza de la Real Chancillería de Valladolid, en las matrículas sacramentales de la diócesis de San Sebastián y Pamplona, y en las licencias de pasaje a Indias del Archivo General de Indias.

Los miembros del linaje Ilisi ostentaron la condición de hijosdalgo de sangre y de solar conocido en Guipúzcoa y Navarra, disfrutando de la hidalguía universal del territorio, exención de pechas e inmunidad tributaria.

Diversas ramas probaron su nobleza, filiación y limpieza de sangre ante la Real Chancillería de Valladolid y ante las Juntas Generales de Guipúzcoa para el reconocimiento de su hidalguía, la obtención de Reales Cartas Executorias e insaculación en los oficios conceiles de representación noble.

En sinople, un castillo, de plata, sobre ondas de agua, de azur y plata, y acompañado de tres flores de lis, de oro, una en el jefe y otra a cada lado. Bordura de gules, con nueve aspas de oro.