El apellido Joaquín (registrado en las fuentes históricas hispánicas bajo las grafías Joaquín, Joachín, Xoaquín, Juaquín y las variantes patronímicas San Joaquín o Juachín) es un linaje de origen antroponímico, patronímico y bíblico-hagiográfico, con una amplia difusión histórica a lo largo de la Península Ibérica (especialmente en Aragón, Cataluña, Castilla y Andalucía) y una notable expansión hacia el continente americano.

Surgió en la Baja Edad Media como patronímico de filiación directa ("el hijo o descendiente de Joaquín") o como hagiónimo para designar a los originarios de una cofradía, ermita o heredad bajo la advocación de este santo, consolidándose como apellido de linaje hereditario.

En los protocolos bajomedievales e inscripciones parroquiales figuró anotado bajo las grafías con sibilante o fricativa Xoaquín o Joachín. Tras la fijación ortográfica castellana en los siglos XVII y XVIII, las escribanías reales y eclesiásticas estandarizaron la forma Joaquín.

Al ser un apellido patronímico, no posee una única casa matriz o "cuna" geográfica, sino que surgió de manera simultánea e independiente en múltiples territorios. Tuvo arraigo destacado en la Corona de Aragón (Zaragoza y Huesca), el Principado de Cataluña y la Corona de Castilla (ambas Castillas y Andalucía).

Durante los siglos XVI al XVIII, numerosas familias apellidadas Joaquín pasaron al ámbito hispanoamericano, arraigando profundamente en los virreinatos de Nueva España (México), el Perú y la Capitanía General de Filipinas (donde fue adoptado masivamente tras el Edicto de Clavería de 1849).

Registrado en los libros sacramentales diocesanos, en el Archivo General de Indias (Sevilla) y en los padrones de moneda forera y estado noble de las merindades castellanas.

Diversas ramas del linaje Joaquín gozaron del reconocimiento de hijosdalgo de sangre en sus respectivas villas, figurando inscritos en los padrones concejiles con exención de pechas y prerrogativas para el ejercicio de oficios de gobierno (alcaldías y regidurías de estado noble).

Las familias más distinguidas de este apellido justificaron su nobleza, filiación y limpieza de sangre ante la Sala de los Hijosdalgo de la Real Chancillería de Valladolid y la Real Chancillería de Granada para la obtención de sus firmas de ejecutoria.

En plata, dos lobos de sable.