El linaje euskérico navarro Juanmartiñena (con sus variantes ortográficas, dialectales e hidalgas Juanmartiñena, Juanmartinena, Juanmartitena, Yuanmartiñena e Yparraguirre de Juanmartiñena, estandarizado según la académica ortografía de Euskaltzaindia como Juanmartiñena) es un antiguo apellido noble de origen patronímico-oikónimo, toponímico y de casa solariega, procedente del Reino de Navarra —con cuna, caserío patrimonial y solar matriz en la Merindad de Pamplona (valles del Baztan, Cinco Villas / Bortziriak, Santesteban / Doneztebe y Bertizarana)— y con una posterior expansión hacia el Territorio Histórico de Guipúzcoa y las tierras de Iparralde.

Surgió en la Baja Edad Media (siglos XIV y XV) para filiar a los herederos e hijosdalgo posesores del caserío patrimonial o casona señorial fundada o poseída por un antepasado llamado Juan Martín ("la casa de Juan Martín" / "Caserío Juanmartiñena"), fijándose como oikónimo toponímico y apellido hereditario de linaje.

En las matrículas sacramentales, expedientes de hidalguía de la Cámara de Comptos y ejecutorias Reales consta anotado indistintamente como Juanmartiñena, Juanmartinena (por omisión notarial castellana de la tilde de la eñe) y la variante fonético-dialectal navarra Juanmartitena (por asimilación de la nasal -in- > -it-).

Tuvo sus primitivas casonas solariegas y caseríos en el Valle del Baztan (Elizondo, Erratzu), Bera, Lesaka, Doneztebe y Sunbilla, extendiéndose tempranamente hacia la frontera guipuzcoana (Irun, Oiartzun) y la Baja Navarra.

A partir de los siglos XVIII y XIX, ramas del apellido pasaron a América, registrándose su presencia en Argentina, Uruguay, México, Chile y Cuba.

Registrado en los libros de la Cámara de Comptos de Navarra, en los expedientes de hidalguía del Consejo Real de Navarra, en los fondos sacramentales de la diócesis de Pamplona, en las probanzas de la Real Chancillería de Valladolid y en los catálogos de pasaje a Indias del Archivo General de Indias.

Los miembros del linaje Juanmartiñena / Juanmartinena / Juanmartitena ostentaron la condición de hijosdalgo de sangre y de solar conocido en el Reino de Navarra, disfrutando de la hidalguía universal del territorio, exención de pechas e inmunidad tributaria.

Diversas ramas probaron su nobleza, filiación y limpieza de sangre ante la Real Corte Mayor y Consejo Real de Navarra, ante las Juntas Generales de Guipúzcoa y ante la Real Chancillería de Valladolid para el reconocimiento formal de su hidalguía, la obtención de Reales Cartas Executorias e insaculación en los oficios conceiles del estado noble.

Escudo cuartelado: 1º y 4º, en plata, un árbol de sinople, y un lobo de sable, linguado de gules, atravesado a su tronco, y 2º y 3º, en oro, cuatro palos de gules. Bordura general de gules con una cadena de oro.

Otros: Escudo cuartelado: 1º y 4º, un árbol de sinople y un jabalí, de sable andante, atravesado al tronco, y 2º y 3º, cuatro barras. Bordura con una cadena. Ignoramos los esmaltes.