El apellido Lobaina (y sus variantes Lobayna, Lovaina o Loubaina) es un linaje muy singular que combina una raíz toponímica e histórica de origen franco-flamenco con una temprana asentación y desarrollo en las Provincias Vascongadas (especialmente en Vizcaya y Guipúzcoa) y su posterior difusión hacia América.

Deriva del nombre de la célebre ciudad de Lovaina (Leuven en flamenco, Louvain en francés), en la región de Flandes. Proviene del germánico Loven / Lobe (bosque, pasto rodeado de vegetación) más el sufijo diminutivo o locativo.

Durante la Edad Media, debido a las intensas rutas comerciales de la lana y la industria naval entre los puertos del Señorío de Vizcaya (Bilbao, Bermeo) y los Países Bajos flamencos, familias mercantes y de artesanos procedentes de Lovaina se establecieron en el País Vasco, adoptando el topónimo de su ciudad de origen como apellido hereditario.

En el contexto puramente vasco, el término sufrió en algunos documentos una asimilación paronímica con la raíz otso / lobo o con la voz vasca loba / luhia (tierra de pastureo o ladera húmeda), si bien la filología antroponímica confirma su tronco franco-flamenco hispanizado en territorio vascongado.

Se encuentra registrado históricamente como Lobaina, Lobayna, Lovaina y Loubaina.

Las casas solares más antiguas registradas con esta denominación en la Península se documentan en Vizcaya y Guipúzcoa a partir del siglo XV, desde donde pasaron a otras áreas del norte de España.

Durante los siglos XVI y XVII, miembros de este linaje pasaron a las Indias, asentándose con especial relevancia en el Caribe (fundamentalmente en Cuba, donde el apellido cobró gran difusión regional) y en el virreinato de Nueva España.

Integrantes de las ramas radicadas en las Provincias Vascongadas hicieron valer su condición de hijosdalgo de sangre de origen (en virtud del fuero de vizcaínes y la hidalguía universal) ante los corregimientos concejiles y en pleitos de exención tributaria incoados ante la Real Chancillería de Valladolid.

Escudo partido: 1º, en campo de oro, una cruz flordelisada y hueca, de gules; medio cortado de gules, con tres palos de oro, y 2º, en campo de sinople, un lebrel, andante, de oro, surmontado de dos flores de lis de plata.