El apellido Nafarrete (registrado históricamente también bajo la forma regularizada Navarrete) es un linaje noble de origen toponímico de extraordinaria antigüedad, hidalguía y hondo arraigo en la historia de la península ibérica. Su cuna y solar primordial se localiza con precisión en la villa de Navarrete, en la comunidad de La Rioja (histórica zona de transición y frontera entre los reinos de Castilla y Navarra), desde donde sus caballeros se proyectaron con gran relieve hacia ambas Castillas, el País Vasco, Andalucía, la Corte de Madrid y, posteriormente, hacia todo el continente americano.

El tronco primordial proviene directamente de la histórica villa de Navarrete, situada en La Rioja. Los caballeros fijosdalgos que ostentaban el dominio jurisdiccional, las heredades o los casales nobles en este estratégico enclave de paso del Camino de Santiago adoptaron el topónimo por apellido familiar hereditario para certificar la legitimidad de su origen y el rancio abolengo de su estirpe. La grafía Nafarrete responde a la fijeza e individualidad que conservaron ciertas ramas eclesiásticas y notariales, manteniendo vivas las raíces fonéticas medievales.

Los originarios de Guipúzcoa, radicado en La Habana, según Vicente de Cadenas, usan: Escudo partido: 1º, en campo de plata, un árbol arrancado, de sinople, y 2º, en campo de gules, tres fajas, de plata.

Otros: En campo de azur, tres espadas, de gules, recortadas de oro.