El apellido Navagier es un linaje de origen antroponímico o toponímico de una frecuencia extremadamente baja, catalogado en genealogía como una auténtica rareza o reliquia familiar en el mundo hispanohablante. No es un apellido nativo o autóctono surgido en España, sino que constituye la adaptación o hispanización gráfica de un apellido de origen italiano (Navagero) o, en su defecto, de una raíz gala o flamenca (Navagier).

La familia Navagero fue una de las familias nobles más importantes de la República de Venecia, dando a la historia célebres humanistas, diplomáticos y poetas como Andrea Navagero (1483-1529), quien fue embajador de Venecia ante la corte del emperador Carlos V en España. Los contactos de estos diplomáticos y comerciantes con los puertos españoles y flamencos (bajo soberanía de los Austrias) favorecieron la dispersión de ramas menores del apellido.

La terminación en "-gier" delata una influencia ortográfica del francés o del flamenco. En las regiones fronterizas de los Países Bajos Españoles o el norte de Francia, el apellido original italiano se afrancesó para adaptarse a la pronunciación local, fijando la grafía Navagier, que posteriormente pudo pasar a España o América Latina.

Debido a su minúscula densidad demográfica, el apellido no cuenta con un desarrollo masivo en la península ibérica, sino que pertenece históricamente a líneas familiares muy específicas ligadas a la diplomacia, los gremios de la seda o el comercio atlántico:

Al investigar registros parroquiales (Quinque Libri) de los siglos XVII al XIX, es habitual comprobar que apellidos extranjeros tan raros sufrían las interpretaciones de los escribanos españoles, apareciendo en ocasiones bajo las formas Navagero, Navajero, Navaguier o simplemente asimilados al común apellido Navarro.

En campo de sinople, dos bandas de oro.

Algunos ponen en el cantón siniestro del jefe una crucecita de oro.