El apellido Roya es un apellido de origen descriptivo o toponímico de una frecuencia extremadamente baja, considerado en genealogía como un linaje de carácter minoritario y muy localizado.

Procede de microtopónimos rurales (parajes, arroyos o colinas) caracterizados por el color rojizo de su tierra o arcilla, muy comunes en la geografía aragonesa y de la Rioja Alta (por ejemplo, el río Mayor o río Roya). Las familias que residían en estos parajes adoptaron el nombre del lugar como apellido.

Los registros parroquiales de los siglos XVI al XIX sitúan las escasas ramas de este apellido en el Reino de Aragón (especialmente en las provincias de Zaragoza y Teruel) y en la zona de la Ribera de Navarra. Las familias Roya de estas zonas estuvieron vinculadas a la vida rural menor y al estamento de labradores acomodados.

En muchos archivos antiguos, el apellido muestra una fuerte inestabilidad gráfica, alternando frecuentemente según el escribano con Royo o Roia, fijándose la grafía Roya de forma definitiva en apenas unas pocas líneas familiares a partir del siglo XVIII.

Los de Asturias usan: Escudo partido: 1º, en campo de gules, un castillo, de oro, y 2º, en campo de plata, dos lobos andantes, de sable, mirando a lo alto. Bordura general de azur con cinco veneras, de plata.